手机浏览器扫描二维码访问
宋河顺手开了一个新程序,按伊雷马实验室数据,同步复现药物预测流程。
别人做的成果,他不敢全盘接收,还是亲自上手验证一下稳妥!
先是经典的ddIs预测,即药物-药物相互作用,探讨病人短时间服用多种药物后,产生的复合效应。
当初在京海大学实验室,吕承恩讲过中药预测五原则,相反为制、相畏为制、相喜为制、相资为制、相恶为制,也是药物和药物相互作用的原理,只不过现代的ddIs预测深入到分子层面了。
之前宋河看相关论文时,见过基于图卷积神经网络的ddIs预测,以及基于平衡理论的预测。
前者太片面,只考虑邻接矩阵元素。而后者则太绝对,总结起来就是“朋友的朋友是朋友”
、“朋友的朋友是敌人”
,但实际的药物研中,关系远比平衡理论要错综复杂。
电脑屏幕上,伊雷马实验室居然两种方法都弃之不用,赫然使用了新方法进行ddIs预测!
宋河研读许久,基本明白了思路……大数据库推导!
伊雷马实验室尝试将海量化合物进行拓展,梳理出亲戚关系,画出一个壮观的树状图,每个枝丫都连接一种相似的化合物。
之后,再通过已经确定的化合物药用特性,大胆猜测未知化合物的药效。
这感觉好比,知道丈夫是生物学家,知道妻子是短跑运动员,于是便猜测这对夫妻将来的孙子能够……一边短跑冲刺一边手拿显微镜观察细菌……
本质上还是瞎猜药物,但在瞎猜中多了一丝丝牵强附会的推理。
“好难!”
宋河吐槽。
他在帖子里寻找伊雷马实验室用的大数据库。
找了半天……没找到?
“怪不得呢!原来公布的只是边缘数据,最核心的没公布啊!”
宋河摇头失笑。
没办法,他只得尝试自己搜集数据库。
他先在网上寻找,用过相似工作方式的科研团队。
花了许久,总共找到两个。
一个是千度公司合作的研团队,通过大量食管癌病人的数据,寻找到22个显着突变基因,随后预测关联出可行的药物信息。
一个是msk癌症中心,开了一个体细胞突变相关的知识库,收录了大量靶向药。
“都是做癌症的数据库,用不上啊!”
宋河挠头。
思前想后,他掏出手机,找相晓桐老师场外求助。
“老师,我需要一个安眠药相关的大数据库,做药物预测用,您知道从哪能弄到吗?学生万谢!”
刚消息,宋河马上后悔,大半夜的,会不会打扰老师休息?
没想到过了几秒,回复便来了。
相晓桐:“我知道谭西教授的团队自建了一个安眠药数据库,但谭西那人小心眼,断不可能提供给你。”
周从心捡到喵主子的时候,它受伤乖巧可怜幼小又无助,刚开始高冷孤傲,后来很快就喜欢被翻来覆去地撸毛,柔软又可爱自从有喵了之后,周从心每天海量更新各种猫片,直播粉红公主装短裙水手服绝育手...
一个默默无闻练武体质烂的小子,因受无妄之灾被劫持到一颗荒星,不知是机偶巧合,还是命运的轮盘无意之间的错乱。越星武,融合人类神秘的源能力,他逐渐走入了一...
◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆附本作品来自互联网本人不做任何负责内容版权归作者所有◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆○●☆★◇◆上错床,喂了狼!作者汐木完結(连城3星VIP)文案上错床,喂了狼!的...
陈根本没有想到,丈母娘在自慰的时候,叫的竟然是自己的名字。 丈母娘叫赵悦,三十八岁,很漂亮,腰很细,腿很长,屁股很大,但嘴角的绒毛很密,看起来很性感,陈听说,这样的女人性欲很强。 透过门缝看着赵悦的手指非快的在溪谷处进进出出的,陈暗暗咽了一口口水,丈母娘的溪谷处特别的肥美,比自己老婆柳如絮的要丰腴得多,干起来一定很爽。...
作品简介危机四伏,利刃出鞘!全球追击,虽远必诛!...
内科医生她真不是沙雕作者花一一文案苏糖才找回前世宫廷太医的记忆,却发现这辈子竟穿成一本早古万人迷文里,被人诬蔑开局立死,给女主提供心脏的路人炮灰。苏糖?提供心脏?医闹诬蔑?你们是皮卡丘的弟弟皮在痒吗?我可是食物链顶端的女人!于是一年后,人人都知道,深市六医院出了一名神医!她在内科,却擅长中医治疗,但凡别人治不好的...